卢旺达国家公园也有一些稀有或濒危的植物物种，如猫尾树和几内亚鸡冠兰等。三个国家公园中所发现的大型哺乳动物种类也是最多的，公园也均属于指定保护区。阿卡盖拉国家公园拥有包括长颈鹿和大象在内的典型稀树草原动物，而火山国家公园则是世界上约三分之一山地大猩猩的栖息地。纽格威森林公园拥有包括黑猩猩和鲁文佐里树栖疣猴在内的13种灵长类动物，其中鲁文佐里树栖疣猴会有多达400只进行群体活动，数量上超过非洲的其他任何灵长类动物。
卢旺达境内生活有670种鸟类，从东到西分布的种类有所不同。西边的纽格威森林发现过280种，其中包括鲁文佐里蕉鹃和艳鹧鸪在内的26种为艾伯丁裂谷特有。卢旺达东部则拥有如乌头黑伯劳之类的稀树草原鸟类，以及习惯生活在沼泽和湖泊地区的物种，如鹳和鹤等。
行政区划
区划
2006年前的省份如下:布塔雷省(Butare)、比温巴省(Byumba)、尚古古省(Cyangugu)、吉孔戈罗省(Gikongoro)、吉塞尼省(Gisenyi)、吉塔拉马省(Gitarama)、基本古省(Kibungo)、基布耶省(Kibuye)、基加利市(Kigali)、基加利-恩加利省(KigaliRural)、鲁亨盖里省(Ruhengeri)、乌姆塔拉省(Umutara)。
2006年1月1日期实行新的行政区划。卢旺达全国划分为4个省(卢旺达语:intara)东部省(Provincedel'Est)、北部省(ProvinceduNord)、西部省(Provincedel'Ouest)、南部省(ProvinceduSud)基加利市(VilledeKigali)和1个市(基加利市)，下设40个县市(akarere)、416个乡镇(umujyi)。
2006年1月1日之前，该国则划分为12个省。后来政府为了解决1994年卢旺达大屠杀引起的问题，决定重组政区。其中首要原因是向地方下放权力，因为当局认为政府权力过于集中是导致种族屠杀的主要因素;其次则是为了使各政区的族群更多元化，以减少族群之间的分化。