航行中，五月花号的主船杆曾出现裂缝，最后要用一口大的铁螺丝钉去修补。
五月花号在加拿大的纽芬兰省，亚法隆半岛南部的靠岸，由当地渔民提供日用品及食水补给，然后向鳕鱼角进发。
他们原本的目的地是在北弗吉尼亚哈德逊河一带的陆地。但因恶劣的天气令航道偏移，在新英格兰过了一个寒冬。这延误令他们无法抵达伦敦维吉尼亚殖民公司容许他们所到的，将来成为了普利茅斯殖民地的地带。
为了平息移民者在航行中积累的纠纷，也为了上岸建立新殖民地以及可能的自治政府作好准备。1620年11月11日，五月花号靠岸于鳕鱼角时，船上102名新移民中的41名成年男子签署了五月花号公约。这份公约成为美国日后无数自治公约中的首例，它的签约方式及内容代表着“人民可以由自己的意思来决定自治管理的方式、不再由人民以上的强权来决定管理。“在此开创了一个自我管理的社会结构，这在王权与神权统治的时代，暗示了许多民主的信念。
《五月花号公约》写道:“为了上帝的荣耀，为了增加基督教的信仰，为了提高我们国王和国家的荣耀，我们飘洋过海，在弗吉尼亚北部开发第一个殖民地。我们这些签署人在上帝面前共同庄严立誓签约，自愿结为民众自治团体。为了使上述目地能得到更好的实施、维护和发展，将来不时依此而制定颁布，被认为是对这殖民地全体人民都最合适、最方便的法律、法规、条令、宪章和公职，我们都保证遵守和服从。“
五月花号于1621年4月5日出发，从普利茅斯殖民地返回英格兰，于1621年5月6日到达英格兰。