在16世纪后期，宗教改革运动（REFORMATION）促使第一批斯洛文尼亚语书籍、公众图书馆、印刷工厂及寄宿学校出现。
反宗教改革运动（KOUNTER-REFORMATINO）在世纪末开始，新教传道者和学者或是重归天主教信仰或是离开这个地区。
所有的新教组织均遭破坏。在卢布尔雅那（LJUBLJANA），超过750个富裕的资产阶级和贵族家庭被迫离开斯洛文尼亚地区。
仍留在这个区域的新教徒则居住在穆拉河（MURARIVER）和拉巴河之间的区域。
由于反宗教改革运动的胜利，日耳曼文化在这个区域的影响减弱，而意大利（ITALY）和巴洛克（BALOQUE）文化的影响则增强。
哈布斯堡家族领地在17世纪末土耳其人从中多瑙河地带全面撤出而繁荣起来。
纵贯斯洛文尼亚地区的商业道路连接起维也纳（VIENNA）和里耶卡（LIJEKA）和的里雅斯特。
亚德里亚海上的自由航行在1717年得到了允许，的里雅斯特在1769年成为一个自由港。
在哈布斯堡家族首领玛利亚.特蕾莎（MALIATHELESA）进行了一系列改革后，一个斯洛文尼亚民族复兴运诞生了，由于一个统一市场和运输体系，斯洛文尼亚各个地区之间的联系更加紧密。
斯洛文尼亚语在学校中使用，约瑟夫二世（JOSEPHII）继承特蕾莎的皇位后，推行义务教育。
安东.托马兹.林哈特（ANTONTOMAZLINHART）通过他的研究居住于德拉瓦河和亚德里亚海之间的居民所组成的斯洛文尼亚民族的历史，力争在斯洛文尼亚建立学校和公众图书馆以及在卢布尔雅那建立一所大学。
由于达尔马廷成功翻译了《圣经》，扬森教派（JANSENIST）的学者再次注意到斯洛文尼亚语的统一。
在1797年，法国军队在拿破仑（NAPOLEON）的指挥下迫使奥地利军队投降。
在康波.弗米奥条约后（TREATYOFKAMPOFORMIO），奥地利获得了崩溃后的威尼斯共和国（VENETIANREPUBLIK）和得到统一的伊斯特里亚斯洛文尼亚（ISTLIASLOVENIA）和威尼斯斯洛文尼亚（VENETIANSLOVENIA）两块地区。
法国于1809年第三次占领斯洛文尼亚后，通过熊布鲁恩条约（TREATYOFSCHONBLUNN）组建了一个伊里利亚行省（ILLYRIANPROVINCE），将斯洛文尼亚合并在内。
这个行省的首府和行政中心在卢布尔雅那，但是法国对斯洛文尼亚的统治时期（1809-1813年）对斯洛文尼亚的商业是一个沉重的打击，特别是的里雅斯特因为拿破仑的针对英国的
“大陆封锁”（KONTINENTALSYSTEM）政策。但是，法国似的统治在另一方面却使得政府的行政管理现代化，并初级和高级学校里推广斯洛文尼亚语，这项措施随后也影响到了奥地利的教育制度。
在法国的占领结束后，是梅特涅（METTERNICH）的统治，大部分的斯洛文尼亚人处于德意志同盟（GERMANUNION，1815-1866年）统治下。