食品加工业
克罗地亚食品加工业较发达，是克罗地亚加工业中就业人数最多的行业，行业总收入位列加工业第一位。克罗地亚主要出口烟草、调味品、汤料、糖果、鱼罐头、牛肉罐头、烈性酒和啤酒，克罗地亚“波斯图普”和“丁加奇”牌葡萄酒及部分火腿肉、奶酪、李子酒等产品享有欧洲原产地保护商标。
制药工业
克罗地亚在医药工业方面有一定的开发和生产能力，每年生产各类医药产品1700多吨。普利瓦（Pliva）药业公司是克罗地亚最大的制药企业，也是东南欧地区领先的药品出口企业，约90%以上的产品出口至美国、俄罗斯和欧盟其他国家等。