.相较于左右两路官军的进展，唯有丁启睿走中路长江逆流而上这支人马，却在出九江之后，进展很不顺利，刑天军水军都统杨昆山此时已经亲自赶到了鄂州坐镇，两个战船营也加强了力量，别离陈驻于黄州和鄂州长江两岸，死死的据守住了长江，在丁启睿挥师开始逆江而上的时候，大批官府战船刚出九江府，便开始在长江上遭遇到了刑天军水营的阻击。中文网
刑天军水营虽然战船不如官军水师多，也没有官军水师的船只坚固，可是贵在这些水营兵将们都很骁勇，两军在长江上一交手，官军便开始连吃败仗，半个月时间便损失战船数十条，兵将数千人之多，而刑天军这边虽然也损失了很多船只军力，可是却远比官军那边的要少许多，使得官军水军始终无法突破鄂州和黄州一带的江面直抵武昌府。
丁启睿其实也预料到了这种情况，在三月下旬的时候，亲自派遣了数百条战船逆流而上，试图一举荡平长江上面的刑天军水寇，于是杨昆山便立即亲率两个战船营迎战，双方于是便在蕲州一带的江面上展开了一场厮杀。
这一仗两军便打了一整天的时间，双方可以都使出了浑身解数，撞船、开炮、发火箭……等等战法都拿了出来，江面上更是火光冲天，喊杀声和惨叫声一天都没有停止过，最终官军在付出了惨痛价格之后，却还是没有能灭失落刑天军的水营，一些兵将驾船便开始失落头逃窜，引发了官军水军的解体，大批官军战船纷繁失落头顺流逃走，结果这一战刑天军获得了大胜。
是一场大胜，其实也只能是一场惨胜，这一战下来，杨昆山身先士卒，坐船更是高挂帅旗居中指挥，使得他的坐船成了官军围攻的目标，大战之中，他的坐船负炮不知几何，船上兵卒更是几乎人人带伤，杨昆山一天下来负伤屡次，可是还是死战不退，下午的时候杨昆山自知伤重难以支持，于是便将指挥权下令转交给了长江水营副都统刘江代他指挥，而他自己则在不久之后，坐船被官军一条战船用炮集中，之后又中了大批火箭和火油罐的冲击，烧成了一团火球，杨昆山于船上的手下全体战亡，无一生还，而杨昆山也成了刑天军自成军之后，损失的级别最高的将领。
也幸好是杨昆山死之前移交了指挥权，刘江及时的在他的坐船上升起了帅旗，继续指挥船队和官军死战，否则的话这一场仗下来，恐怕是刑天军水营就要以失败告终了。
官军也正是看到刑天军始终都没有失去指挥，并且似乎是越战越勇，一条条刑天军的战船着火之后，船上的水卒们不但不弃船跳水逃生，反却是奋勇驾船冲向官军船队，用铁钩钩挂住官军船只，与之同焚，如此之下，官军在军力船只占优的情况下，却始终没有能掌握住江面上的主动权，最终败逃回了九江府。
不过官军水师溃退之后，刘江这边也已经没力气再挥兵掩杀了，他们两个战船营一天激战下来，船只受损跨越了六成，兵将更是伤亡过半，刑天军的在陆地上的优势，在江面上却无法阐扬出来，之所以能打胜这一仗，可以全是凭借水军的兵将们拿命换来的，除杨昆山这个水营都统阵亡之外，两个水营还有一正一副两位营将阵亡，损失可谓是极大，故此在官军水师溃退之后，刑天军这边也早已无力再战了，刘江只能下令收兵，撤回鄂州赶修船只，以备再战。
而这个时候丁启睿气的是大发雷霆，请出了尚方宝剑，将几个临阵脱逃的水师军将给斩了，要继续出兵攻打鄂州，可是在这个时候，从北面传来了肖刑天在阳谷县大败官军的消息，并且生擒督师孙传庭、阵斩辽东总兵吴三桂。
丁启睿闻之马上便大惊失色，在九江府的大营之中顿足大哭了起来，他没有想到北面官军败的会这么快，在他看来，孙传庭也算是能臣了，现如今朝廷调入关内数万精兵，这么多人马怎么也够孙传庭对刑天贼了，不敢孙传庭一定可以在北方击败刑天贼，起码以他的军力拖住刑天贼是没有问题的，这样一来即可以给他争取相当的时间来克复武昌府了！
可是没成想这才多长时间呀！孙传庭便落得了一个兵败被俘的下场，麾下数万大军瞬间便灰飞湮灭，接下来肖刑天要怎么做，丁启睿便猜不出了。
从丁启睿的角度解缆，现如今孙传庭和大批辽东的官军已经被刑天军所灭，那么接下来如果刑天军想要覆灭大明的话，北方官军数量已经不足以扛住刑天军大军的进攻，肖刑天完全可以集结重兵北上，直接打京师，只要京师一克，那么大明也就基本上可以完结了。
可是肖刑天会这么做吗？他还有一个选择，那就是在解决失落了北方官军的威胁之后，继续依照以前的既定计划攻打南直隶，待取下南直隶之后，再北上攻打京师，如此一来，将会更完全的将大明给覆灭失落。
丁启睿阐发过之后，最终在没有足够的信息支持之下，也无法判定肖刑天接下来会怎么做，于是将心一横，派人告知黄得功，令其务需要尽快攻克黄州，同时令左翼军也尽快攻打鄂州，先买通长江之后，出兵武昌府，不管怎么，他都要先拿下武昌府之后再，一旦打下武昌府的话，最起码也能冲击一下刑天贼的气势。
于是在三月底的时候，官军便开始对黄州和大冶县策动了猛攻，黄得功率领右翼军的近两万戎马，在三月二十七的时候进至了黄州城外，将黄州城给半包抄了起来，开始对黄州城策动了猛攻，而左翼军在总兵方国安的率领下急攻大冶县，至此最为凶险的战事也就在黄州和大冶一带展开了。
在罗汝才的调遣之下，坐镇黄州的乃是老回回，老回回先前受命之后，率领了一个乙种营和两个丙种营入驻黄州，军力不过四千不到，面对的却是黄得功等两万余官军的围攻，在黄得功率部抵达黄州之后，老回回便立即先是率兵出城对黄得功策动了一次逆袭，黄得功没有想到刑天军居然在军力不足的情况下还敢出城逆战，所以不防之下，先是大败了一场，在得知镇守黄州的乃是老敌手老回回马守应之后，更是气不打一处来，立即便调遣戎马开始攻城。
而老回回则在黄州城临时招募了大批周边民壮助战，把整个黄州城外面提前挖的是沟壑纵横，并且在黄州城内外安插了很多的先前缴获官军的大炮，日夜对攻城的官军轰击不断，并且频频不竭的派出麾下的兵将进行逆袭抑或是夜袭，战事打的很是惨烈，老回回手中的三个战军营装备的火铳数量不多，可是战意却很是盎然，三千多兵将轮番镇守和出击，愣是在黄州城顶住了黄得功所部近十天时间的猛攻，黄得功在黄州城外始终不得寸进，双方伤亡都很是大，到了第十天的时候，老回回手下仅剩下了不到两千可战之兵，其余的则只有数千助战民壮了，于是老回回将黄州城的青壮也武装了起来，据城死守，使得黄得功好不容易攻到城下，却还是不得攻克黄州。
与此同时丁启睿派出了五千援军，走陆路赶至黄州城助战，黄得功在获得援军的增援之后，更是攻城猛烈，老回回则亲自登城指挥防御，几处城墙激战之下数度易手，可是最终都被老回回率部给堵了回去。